Der Vorsitz des Eurodistrikts PAMINA wechselt alle drei Jahre tournusgemäß zwischen den drei Teilräumen (PA-MI-NA). Seit dem 19. April stellt die Südpfalz den Präsidenten und somit höchsten politischen Vertreter der EVTZ.
Den stellvertretenden Vorsitz haben immer die beiden Teilräume inne, die nicht den Vorsitzenden stellen. Dies sind aktuell das Nordelsass und der Mittlere Oberrhein. Die stellvertretenden Vorsitzenden unterstützen den Vorsitzenden bei seiner Arbeit.
Die Versammlung ist das höchste Gremium des EVTZ Eurodistrikt PAMINA. Sie tagt zwei Mal jährlich und beschließt über grundsätzliche Angelegenheiten, welche u.a. den Haushalt, Satzungsangelegenheiten oder die politischen Leitlinien der grenzüberschreitenden Zusammenarbeit betreffen. Die Versammlung umfasst 33 Vertreter (elf pro Teilraum).
Der Vorstand ist ein wichtiges Entscheidungsorgan des EVTZ Eurodistrikt PAMINA. Da er mehrmals im Jahr tagt, werden hier bspw. Beschlüsse über Fördermittel oder andere Entscheidungen getroffen, die zeitnah erfolgen müssen. Der Vorstand umfasst 12 Vertreter (vier pro Teilraum).